懷(huai)孕(yun)期間的(de)(de)親子鑒(jian)定和(he)(he)孩子出生(sheng)后的(de)(de)親子鑒(jian)定的(de)(de)費用差異主要(yao)是(shi)由于所涉(she)及的(de)(de)檢(jian)測技術和(he)(he)流程的(de)(de)差異。孕(yun)期親子鑒(jian)定通常采(cai)用無創產前(qian)親子鑒(jian)定（NIFTY）技術，需要(yao)提(ti)取父(fu)母和(he)(he)胎兒(er)的(de)(de)DNA數據(ju)進行比對(dui)，形(xing)成三聯體比較。這意味著實驗室需要(yao)處(chu)理和(he)(he)解析(xi)三個不同(tong)個體的(de)(de)遺(yi)傳(chuan)信息，而不僅僅是(shi)一(yi)個孩子和(he)(he)一(yi)名疑似父(fu)親的(de)(de)遺(yi)傳(chuan)信息。

在(zai)懷孕期間進行親(qin)(qin)(qin)子鑒定時(shi)，采用非侵(qin)入性(xing)(xing)方法，通常通過(guo)分(fen)析母(mu)親(qin)(qin)(qin)的血(xue)液樣本并(bing)分(fen)離(li)(li)胎(tai)兒游離(li)(li)DNA。這(zhe)種方法的復雜(za)性(xing)(xing)在(zai)于，胎(tai)兒DNA  只占母(mu)親(qin)(qin)(qin)血(xue)液中所有DNA  的一(yi)小部分(fen)，因(yin)(yin)此需(xu)要高度精確(que)的測試來(lai)識別和分(fen)離(li)(li)這(zhe)種遺(yi)傳物質(zhi)。此外，為了保證結果的準確(que)性(xing)(xing)，孕期親(qin)(qin)(qin)子鑒定通常檢測到(dao)的基因(yin)(yin)位點遠多于孩子出生后(hou)的親(qin)(qin)(qin)子鑒定，可達13000多個位點。

相(xiang)比之下，孩子(zi)出生后的親子(zi)鑒定(ding)通(tong)常分為(wei)兩部分，這意味著(zhu)僅比較(jiao)(jiao)孩子(zi)和(he)(he)疑(yi)似父親的DNA  樣(yang)(yang)本(ben)(ben)(ben)。在這種(zhong)情況(kuang)下，樣(yang)(yang)本(ben)(ben)(ben)采集更加(jia)直(zhi)接和(he)(he)簡單(dan)，通(tong)常通(tong)過(guo)口腔(qiang)拭子(zi)或血液樣(yang)(yang)本(ben)(ben)(ben)進(jin)行。由于樣(yang)(yang)本(ben)(ben)(ben)來(lai)源較(jiao)(jiao)為(wei)明確(que)，無需處(chu)理胎兒DNA分離等(deng)復雜(za)問題(ti)，因(yin)此檢測過(guo)程相(xiang)對簡單(dan)且成本(ben)(ben)(ben)低廉。

孕期(qi)親子鑒(jian)(jian)定(ding)(ding)費用高(gao)于孩子出(chu)生后(hou)的(de)(de)主要原因(yin)是孕期(qi)檢(jian)(jian)測需要更(geng)先進的(de)(de)技術、更(geng)復雜的(de)(de)實驗室程序(xu)、更(geng)多(duo)的(de)(de)基因(yin)位點(dian)檢(jian)(jian)測才能保證結果的(de)(de)準(zhun)確性。這些因(yin)素結合起來(lai)增加了懷(huai)孕期(qi)間親子鑒(jian)(jian)定(ding)(ding)的(de)(de)費用。